La presente investigación tuvo como objetivo general demostrar que la aplicación de una auditoría operativa optimiza la gestión del almacén de materia prima de una empresa dedicada a fabricar productos de molinería en la ciudad de Tacna, en el año 2014. Para dar cumplimiento a este objetivo se realizó una investigación descriptiva. El fundamento teórico de la investigación precisó como variable independiente la Auditoría operativa y como variable dependiente la Gestión del almacén de materia prima. La población utilizada para la presente investigación fue de veinticuatro trabajadores que tienen relación con el trabajo del almacén. Se les aplicó como instrumento de recolección de datos el cuestionario, aplicado como censo al total de la población. La conclusión más importante fue que la aplicación de una auditoría operativa mejoraría significativamente la gestión del almacén debido a una mejora en el cumplimiento de los objetivos propuestos y en la eficacia y eficiencia en la utilización de los recursos dispuestos para el almacén de materia prima.